2021年9月21日，苏丹安全机构和军方于凌晨挫败了一起政变企图，涉案人员已被逮捕并正在接受调查，局势得到控制。

苏丹处于北非和东非的交界地带，古埃及，拜占庭，阿拉伯帝国曾先后征服这一区域。加上气候和地形的影响，使得苏丹3/4的人口居于北部且多为阿拉伯穆斯林，南部多为黑人。然而，苏丹75%的石油资源位于南部，北部仅占25%。

641年，阿拉伯人占领埃及，并传入伊斯兰教。651年，阿拉伯人自埃及向南入侵努比亚（今苏丹），阿拉伯穆斯林从埃及、阿拉伯半岛等地大规模向苏丹移民，不断挤压土著黑人的生存空间，伊斯兰教便在努比亚传播开来。1821年，芬吉苏丹国被埃及阿里王朝征服，但却凭借欧洲新式武器，重占努比亚及南部的白尼罗河。1874年，埃及阿里王朝占领加札尔河及达尔富尔地区。

19世纪末，英国势力向苏丹渗透。1881年8月，苏丹宗教领袖穆罕默德·艾哈迈德宣布自己是马赫迪（救世主），号召人民掀起驱逐侵略者的“圣战”，建立“普遍平等，处处公正的美好社会”，史称马赫迪起义。1881年12月和1882年3月，起义军均两次击败埃及远征军。1883年11月，约4万起义军歼灭1万余名英军1万多人。

1884年3~7月，4万起义军包围喀土穆。英国苏丹赤道省总督戈登软硬兼施，一方面许诺减税、自治、解放奴隶，另一方面以英援军即将抵达为恐吓，但起义军不为所动。1885年1月26日，喀土穆解放，戈登（参与焚烧圆明园、镇压太平军）被击毙，英军撤出苏丹。1885年6月，艾哈迈德病逝，弟子阿卜杜拉自称哈里发（伊斯兰国家元首），建立了统一的伊斯兰封建国家——马赫迪王国，定都恩图曼。

经济上，阿卜杜拉大力刺激商业活动，推动工业化，使马赫迪王国成为非洲最发达的国家。军事上，阿卜杜拉向欧洲购入新式军舰，在阿比西尼亚、坦葛尼喀和乌干达尔等地实行殖民统治，远征摩洛哥。文化上，阿卜杜拉废除旧风俗，宣扬男女平等，一夫一妻和婚姻自由，发展现代教育。

1896年，基切纳率英军向南进攻苏丹，起义军在1896年9月的栋古拉战役和1898年9月的恩图曼战役中接连失败，马赫迪起义被镇压。阿卜杜拉率残部退入科尔多凡展开游击战。战死后，侄子艾哈麦迪·哈桑继位。

1899年1月，英埃签署《英埃关于共管苏丹的协定》，苏丹总督由英国人担任，名义上由埃及任命。苏丹实际上沦为英国殖民地，哈桑成为傀儡。3月，英法两国就中非地区的势将范围达成协议。

马赫迪王国的行政院（Executivement，行使最高行政权）由英国变相掌管，酋长院（Congressment of Emirs，主管伊斯兰教活动）于1902年被英、埃强制解散，苏丹资产阶级须同时向马、英、埃三国缴纳高额营业税，苏丹经济和政治秩序被彻底打乱。

1945年底，苏丹民族党成立，主张以对英协商的手段获得独立。1948年，英国殖民当局组织的立法会议选举遭苏丹人民抵制，大规模罢工不断。1951年10月，埃及宣布废除《英埃关于共管苏丹的协定》，苏丹人民示威游行，要求英国撤军和苏丹独立。11月，苏丹工会联合会成立。

1953年2月，英埃达成协议，给予苏丹自治政府和自决权。1954年1月，民族联盟合党在议会选举中获胜，组成苏丹民族政府。1956年1月1日，苏丹正式宣布独立，成立苏丹共和国。

1958年11月17日，文官政府被政变推翻，易卜拉欣·阿布德（Ibrahim Abboud）建立军政府。阿布德大力推行阿拉伯化。为压制南方基督教势力，1962年5月，阿布德政府颁布《传教士法》，南方反政府武装“阿尔亚尼亚运动”（Anya Nya）成立并与政府军展开游击战。1964年2月，阿布德下令驱逐苏丹南部的外国传教士，本土传教士被镇压。1964年10月28日，阿布德政府倒台，苏丹成立过渡政府，维持1956年宪法。

1965年3月，穆罕默德·艾哈迈德·马哈古卜（Mohammed Ahmed Mahgoub）在大选中获胜，成为总理。次年7月，议会通过不信任案，马哈古卜辞职，萨迪克·马赫迪任新总理。1967年3月，马赫迪政府倒台，马哈古卜再次为总理。次年，为解决政治危机，马哈古卜解散议会，于4月重新大选并获胜，继续当总理。

1969年5月25日，加法尔·尼迈里上校（曾于1966年在美国堪萨斯州莱文沃斯堡陆军指挥学院受训）发动政变，成立军政府，国名变更为“苏丹民主共和国”。尼迈里政府宣布停止宪法，禁止政党活动。1969年11月，尼迈里自封总理，清剿苏丹共产党。1970年3月，尼迈里挫败萨迪克‧马赫迪右翼叛乱。1971年7月19日，苏丹共产党发动政变，尼迈里一度被俘，但政变最终失败。苏丹共产党再次被清洗。

1971年9月，尼迈里在全民公决中以98.6%的绝对多数当选总统，任期六年。同年，南苏丹解放运动（Southern Sudan Liberation Movement）成立。尼迈里任内坚持亲西方道路，推动银行私有化并引进外资，着力发展农业。1972年，苏丹政府和南苏丹解放运动在亚的斯亚贝巴展开和谈。3月27日，双方签署《亚的斯亚贝巴协定》，结束了长达27年的第一次苏丹内战。

1973年，苏丹颁布新宪法。1976年，萨迪克·马赫迪在利比亚支持下率军攻入喀土穆。1977年，双方和解，尼迈里再次当选总统，马赫迪和他的苏丹民主统一党加入联合政府。新政府的伊斯兰教政策更为强硬，也更亲西方，全部苏联专家在当年被驱逐。尼迈里是第一个支持萨达特与以色列和谈的伊斯兰国家元首。

1983年，尼迈里宣布终止《亚的斯亚贝巴协定》。6月5日，尼迈里政府将南苏丹地区分为赤道、加札尔河、上尼罗三省，取消了南方的自治地位。9月，尼迈里政府颁布“九月法令”，全面推行伊斯兰教法（沙里亚法），引起了以非穆斯林为主体的南苏丹人的不满。

1983年底，第二次苏丹内战爆发，约200万人丧生，450万人背井离乡。美国趁乱介入，在乍得设立基地，培训南苏丹民族解放军，十年内提供12亿美元的军火。

1985年4月6日，阿布德·拉赫曼·苏瓦尔·达哈卜（Abd al Rahman adh Dhahab）将军乘尼迈里访问美国时，发动政变将其推翻，成立过渡军事委员会，但沙里亚法未被终止。1985年12月15日，国名被改回“苏丹共和国”。

1986年，苏丹举行大选，萨迪克·马赫迪成为总理，达哈卜将政权交给民选的萨迪克政府。1988年11月，萨迪克政府和南苏丹解放运动等在亚的斯亚贝巴签署新的和解协定，承诺停火、冻结沙里亚法等。1989年6月30日，在沙里亚法废除表决前24小时，奥马尔·哈桑·艾哈迈德·巴希尔上校发动政变，推翻萨迪克政府。

1991年1月，巴希尔宣布除南方三省外，苏丹全国在经济社会文化领域实施伊斯兰宗教化，推广阿拉伯语，传播伊斯兰教。

外交上，巴希尔谋求成为伊斯兰世界的领导者之一。自1990年起，巴希尔庇护基地组织，允许其在苏丹展开圣战长达6年之久。1991年4月，阿拉伯和伊斯兰人民大会在苏丹首都喀土穆召开，巴勒斯坦解放组织哈马斯，黎巴嫩真主党等伊斯兰政治组织均派代表参加。大会认为，阿拉伯-伊斯兰世界应团结起来，抗击外国“十字军”。

1993年8月，美国将苏丹列入“支持恐怖组织国家名单”。1996年起，美国对苏丹实施经济制裁，直到特朗普上台后才部分解除。1998年8月，美国对苏丹和阿富汗实施代号“无所不至”的导弹袭击。1999年，苏丹背负了近200亿美元的外债。

2002年，苏丹政府与苏丹人民解放运动（SPLM，主要是非穆斯林的苏丹南部黑人）进行和平会谈。在美国，英国和挪威的斡旋下，双方于当年7月签署《马查科斯议定书》，谈判取得初步成果。2004年12月31日，双方签署永久停火议定书。次年1月9日，双方正式签署《全面和平协定》，第二次南北战争结束。按照协定，苏丹设立6年过渡期，南部自治区获得国家石油收入的1/3，并可在过渡期结束后就南苏丹人民自决权利举行全民公投。

鉴于巴希尔在达尔富尔地区的强奸、谋杀、酷刑等暴行中的“重要角色”，2009年，海牙国际刑事法庭指控其犯有战争罪和反人类罪。巴希尔也成为首个被通缉的在任国家元首。

2011年2月7日，根据《全面和平协议》南苏丹公投结果显示，98.83%的选民支持南部地区从苏丹分离。巴希尔随即宣布承认和接受苏丹南部公投结果。2011年7月9日，南苏丹正式成立，萨尔瓦·基尔·马亚尔迪特（SPLM领导人，南方自治政府主席）为首位总统，签署《南苏丹过渡期宪法》。

南苏丹总统、副总统、议长分别来自丁卡族、巴里族、努维尔族三大族群，内部并不团结。为整顿军纪，2013年2月，马亚尔迪特将100余名将领强制退休，引起军人不满。7月23日，里克·马查尔副总统与整个内阁被总统解散。12月14日，马查尔策动总统卫队政变。马亚尔迪特总统称已粉碎其阴谋，但武装冲突迅速扩大。

2013年12月15日，南苏丹总统基尔·马亚尔迪特领导下的丁卡族武装与努维尔族爆发武装冲突，南苏丹内战全面爆发。2014年1月、5月分别达成停火协议却一再被撕毁。2014年7月25日晚，世界粮食计划署与联合国儿童基金会联合声明：7个多月来，南苏丹政府军和叛军、民兵的战斗已造成数千人死亡，超过150万人成难民，南苏丹即将出现饥荒。

2016年4月，马查尔返回首都朱巴，就任“南苏丹民族团结过渡政府”第一副总统。2016年7月，支持总统基尔和支持副总统马查尔的士兵在朱巴爆发新冲突。7月25日，基尔发布总统令，宣布解除马查尔的第一副总统职务。2018年3月，包括南苏丹解放运动（SSLM）在内的9个反对派武装组成了南苏丹反对派联盟与政府谈判，苏人解并未参与。

2017年9月，美国宣布对南苏丹实施制裁。2018年3月，制裁力度进一步加大。9月，南苏丹总统基尔与马查尔在亚的斯亚贝巴签署和平协议，为期五年的内战结束，马查尔官复原职。截至2019年，南苏丹内战造成约45万人死亡，300多万人流离失所。2020年2月22日，反对派参与下的民族团结过渡政府成立，马查尔再次就任第一副总统，内战告一段落。

巴希尔掌权以来，苏丹一直没能摆脱对农牧业自给经济的高度依赖，即便是在中南部发现石油之后，农业、工业和资源开采的发展也非常有限。这与西方国家借援助之名掠夺苏丹资源不无关系。于是巴希尔与中国展开紧密合作，自1995年起，中国就成为苏丹的主要直接投资来源国，2014年，中国投资占苏丹外国投资总额的89%。中石油在苏丹建立了一个相对完整的石油工业体系，油田年产数千万吨，多数运往中国。

随着南苏丹的独立，苏丹失去了3/4的石油收入。苏丹混乱的局势，落后的基础设施，几乎为零的工业基础，使得巴希尔的“现代农业计划”几乎没有进展。苏丹的矿产和天然气储量少，加之管理不善，减少石油依赖的方案又被搁置。而巴希尔又将大量预算投入军事和安全领域，教育医疗等民生项目占比不高，百姓开始不满。

正当苏丹身处困境之时，2016年，苏丹的国际处境随着美国解除部分制裁而逐渐好转。巴希尔决定按照国际货币基金组织的路线图实施经济改革，以获得资金援助。妄图短时间解决长期存在的经济结构性问题。

国际货币基金组织开出的要求包括：苏丹在2018年初完全放开汇率，放弃粮食燃油价格管制，取消生活必需品政府补贴，限制非必需品进口——与拉美国家的“新自由主义”和东欧各国的“休克疗法”如出一辙。政府补贴取消后，苏丹生活必需品价格飙升，物资供应困难。苏丹镑贬值更加严重，国际油价低迷，进一步增加了苏丹的财政赤字。人民生活遭受极大困难。

2017年12月19日，苏丹北部城市阿塔巴拉出现大规模示威活动，迅速席卷全国15个州。苏丹职业者协会于当年12月25日要求巴希尔离职，此年1月又发表《自由与变革宣言》，在群众抗议浪潮中获得重大影响力。

鉴于2020年即将大选，没有认识到问题严重性的巴希尔拒绝辞职。他一方面于2月22日宣布实施紧急状态，关闭学校，逮捕大量抗议者和反对派领袖，解散联邦政府并解雇全部州长，另一方面承诺进行“真正的经济改革”。

为时已晚。2019年4月11日，苏丹发生军事政变，总统巴希尔被逮捕，并被解除一切职务。

巴希尔在IMF专家的建议下实施的脱离实际的经济改革，最终葬送了他的政治命运。可是在危难关头，美国、欧盟与联合国只在口头上对巴沙尔的改革努力表示肯定，并希望苏丹恢复稳定。同属伊斯兰世界的沙特、卡塔尔、埃及、巴林、科威特、土耳其等国虽然纷纷伸出援手，也无济于事。